V rokoch 1677-1680 sa arcibiskup Szelepcsényi podujal na základnú prestavbu vodného hradu. Prestavbou vznikol renesančný kaštieľ, rovnako ako hrad, obkolesený vodnou priekopou, ktorej časti sa zachovali až dodnes. V tomto období bola k objektu pristavená kaplnka.

Koncom 18. a v 19. storočí patrilo malinovské panstvo Apponyiovcom, ktorí túto poschodovú štvorkrídlovú budovu v prvej polovici 19.storočia prestavali a kaštieľ dostal dnešný klasicistický vzhľad.

V súčasnosti sa v ňom nachádza Združená stredná škola záhradnícka Gustáva Čejku, ktorej korene siahajú do obdobia prevej Československej republiky. Kaštieľ je obkolesený rozsiahlym anglickým parkom s cudzokrajnými drevinami, ktorý je prístupný pre verejnosť.